Los colibríes no tienen mucha protección en su hábitat natural, son capaces de volar rápidamente y se mezclan, a menudo, con su entorno, llamar la atención para varios depredadores podría significar el fin para ellos. Los depredadores específicos a los que podrían enfrentarse dependen de su ubicación y la época del año en la que se encuentren.
El mayor depredador del colibrí es la familia de los gatos. En muchas regiones hay gatos domésticos que los capturan cuando se detienen para posarse, alimentarse, e incluso subir a los árboles, también los encuentran en sus nidos. En la naturaleza existen muchos tipos de gatos que son excelentes cazadores, y tienen el factor sorpresa de su lado, encuentran el colibrí como una comida rápida que van a consumir si la oportunidad se presenta.
Dado que este tipo de ave es tan pequeña se convierten en presa de otros grandes tipos de aves. Es muy común que los halcones se alimenten de los colibríes, estos últimos se encuentran a menudo en zonas donde el halcón habita también. El halcón posee una excelente visión y una increíble velocidad que hace que el colibrí tenga muy pocas posibilidades de escapar una vez que ha sido detectado.
En algunas regiones, otro tipo de ave llamada Blue Jay, es también bien conocida por alimentarse de las especies pequeñas de Colibríes. Existen abundantes tipos de serpientes que viven en los mismos árboles que algunos colibríes , estas serpientes se mezclan bien con el entorno y pueden deslizarse silenciosamente, cuando el pájaro sepa que la serpiente está presente será demasiado tarde para escapar.
Las serpientes suelen encontrar a los pequeños huevos de los colibríes en sus nidos de los árboles y no perderán la oportunidad de cenar con ellos. Cuando la madre sale a buscar alimento es el momento cuando los huevos son más vulnerables. La mantis religiosa es también un depredador de estas pequeñas, también se mezclan en los alrededores por lo que un colibrí puede aterrizar muy cerca de ellos sin darse siquiera cuenta.
La mantis religiosa es un excelente cazador con movimientos calculados que ataca con la velocidad de la luz. Puede tomarle varios días a una mantis religiosa alimentarse de un colibrí por lo que los considera un excelente partido en términos de supervivencia final.
Las especies muy pequeñas de colibrí también pueden ser víctimas de grandes tipos de arañas en su hábitat natural. Algunas de ellas crean telas en las que el colibrí se puede enredar, otras atacarán de la nada e inyectarán el veneno que inmovilizará al ave.
Ambas abejas y avispas también se han encontrado alimentándose de los pequeños colibríes.
Los seres humanos pueden ser un riesgo para los colibríes también, pero no existe demasiada gente con ganas de matarlos, algunos, sin embargo, los ven como plagas y destruyen los nidos que hacen en los árboles. El uso de plaguicidas es otra forma en que los seres humanos se han convertido en una amenaza para esta especie de aves.
En general, los depredadores explican la razón por la cual más de la mitad de todos los colibríes mueren antes de cumplir 1 año de edad. En las zonas donde otras fuentes de alimentos son escasas, este tipo de depredadores siguen recurriendo a los colibríes para su propia supervivencia.